截至今年9月底，全区累计报告艾滋病病毒感染者20890例，累计报告感染者人数位居全国第四，人群感染率位居全国第二。感染者以青壮年为主，其中艾滋病病人1256例，死亡462例。新疆艾滋病疫情分布于全区14个地、州、市的90个县、市、区，主要集中在伊犁、乌鲁木齐、阿克苏和喀什地区，占全区艾滋病病毒感染者的88％，其他地区感染人数也逐年增加，蔓延趋势明显。

    新疆艾滋病传播以静脉注射吸毒共用注射器为主，占全区累计报告感染人数的77％左右；性传播和不明原因传播所占比例持续增加，2006年已分别达到13％和16％；女性感染者人数增长速度加快，占累计报告人数的21％；母婴传播形势日趋严重，已累计报告经母婴途径传播的新生儿感染者91例，防控形势十分严峻。